記者2023年12月29日從蘭州大學(xué)獲悉，該校反芻動(dòng)物研究所王維民教授團(tuán)隊(duì)發(fā)布了國(guó)內(nèi)首款基于大規(guī)模基因組選擇參考群的高性能綿羊基因組育種芯片“蘭大·華羊芯”。這是該團(tuán)隊(duì)組織實(shí)施的“綿羊雙萬羊基因組計(jì)劃”第一階段的成果。

為提升我國(guó)綿羊基因組育種技術(shù)水平，王維民團(tuán)隊(duì)通過持續(xù)精準(zhǔn)的大規(guī)模性能測(cè)定與基因組重測(cè)序，率先在國(guó)內(nèi)構(gòu)建規(guī)模達(dá)10318只、羊只來源覆蓋全國(guó)8家國(guó)家湖羊核心育種場(chǎng)和4家規(guī)模化湖羊種羊場(chǎng)的基因組選擇參考群，累計(jì)獲得了80萬條表型數(shù)據(jù)和78TB的基因組數(shù)據(jù)。研究團(tuán)隊(duì)繪制出包含2000萬個(gè)高質(zhì)量遺傳變異位點(diǎn)超高分辨率的湖羊基因組遺傳變異圖譜，鑒定出飼料轉(zhuǎn)化率、生長(zhǎng)速度、尾脂重、肌內(nèi)脂肪等一系列湖羊重要經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)鍵基因。

此后，研究團(tuán)隊(duì)聯(lián)合石家莊博瑞迪生物技術(shù)有限公司，利用大數(shù)據(jù)、生物信息學(xué)、育種學(xué)等相關(guān)技術(shù)，研發(fā)出包含45052個(gè)具有代表性、全局性、功能性位點(diǎn)的高性能45K基因組育種芯片“蘭大·華羊芯”，并衍生出可在不同應(yīng)用場(chǎng)景下靈活使用的10K低密度和1K超低密度兩款配套使用的系列育種芯片。“芯片配套的遺傳評(píng)估技術(shù)，可用于湖羊基因組選擇育種、重要經(jīng)濟(jì)性狀基因定位、品種鑒定、家系劃分、系譜校正等。”王維民介紹。

據(jù)了解，“蘭大·華羊芯”的設(shè)計(jì)和遺傳評(píng)估技術(shù)已經(jīng)過業(yè)內(nèi)專家反復(fù)論證，并在天津奧群牧業(yè)有限公司、甘肅潤(rùn)牧生物工程有限公司等有關(guān)企業(yè)進(jìn)行了近萬只羊的驗(yàn)證。結(jié)果顯示，該育種芯片在重要經(jīng)濟(jì)性狀的選種準(zhǔn)確性上已經(jīng)可以比肩國(guó)際同類產(chǎn)品，尤其是在我國(guó)綿羊育種技術(shù)領(lǐng)域最具潛力的突破性性狀飼料轉(zhuǎn)化率的基因組預(yù)測(cè)方面，填補(bǔ)了全球綿羊基因組選擇育種技術(shù)的空白。